O informe, que agora foi desclasificado polo Departamento de Estado de Estados Unidos, foi publicado en marzo de 2005 polo xornalista de Público Danilo Albín. George W. As "boas relacións" entre os gobernos presididos por Bush e José María Aznar facilitaron o apoio mutuo na "loita global contra o terrorismo". Neste contexto, e segundo o documento desclasificado, os servizos de intelixencia de Bush tamén mantiveron en 2004 relacións co Goberno Vasco, dependente do nacionalista Juan José Ibarretxe: "Estados Unidos deu unha formación antiterrorista á Policía do País Vasco", indícase no informe. Javier Balza dirixía entón o Departamento de Interior. Preguntado por Público,o Goberno Vasco non quixo facer ningún comentario sobre este tema.

O documento, de 2005, dá conta dunha nova xornada de traballo de funcionarios estadounidenses: A Ertzaintza foi formada xunto cos Mossos e a Policía Nacional no que se refire á "investigación policial".

1999-2009: Ertzaintza, Ibarretxe -Balza e a tortura

Segundo o informe do Goberno Vasco sobre casos de tortura en Euskal Herria entre 1960 e 2014, a Ertzaintza ha torturado a 336 cidadáns, entre os 4.113 casos de tortura daquela época. Na década na que Juan José Ibarretxe era lehendakari e Javier Balza conselleiro de Interior –entre 1999 e 2009– a Ertzaintza torturó a polo menos 125 persoas. Balza naquela época negou en varias ocasións as torturas da Ertzaintza nos medios de comunicación e no Parlamento Vasco. Balza, por exemplo, afirmou en 2002 que as denuncias de torturas dos detidos "son unha práctica habitual como consigna para identificar aos ertzainas que participan nos interrogatorios".

Javier Balza abandonou a primeira liña da política profesional, á vez que se converteu en conselleiro de Interior. Desde 2009 traballa como avogada no gabinete Uria Menéndez, unha das principais referencias do capitalismo español. Defendeu a Petronor, liderado polo seu compañeiro de partido, Josu Jon Imaz, e a Gorka Iraizoz.