El context actual pot tenir una greu conseqüència a l'Àfrica Subsahariana: Duplicació del nombre de morts per paludisme. En lloc de fer front al coronavirus, es preveu que es redueixin les distribucions de mosquits i de remeis contra el paludisme. Això pot provocar l'augment de la malaltia.
L'Organització Mundial de la Salut (OMS) ha fet una crida a continuar ferma amb la lluita contra el paludisme, malgrat que la lluita contra el coronavirus sigui imprescindible. Seguint els càlculs d'aquesta estructura, en el pitjor dels casos, el paludisme arribarà a les 769.000 morts en 2020 a l'Àfrica Subsahariana, dues vegades més que en 2018. 405.000 van morir a causa d'aquesta malaltia en 2018.
Aquesta regió del món és la més afectada pel paludisme, amb un 93% de casos. A més, el coronavirus també s'està estenent en aquest continent i l'OMS també ha encès l'alarma sobre aquest tema:El director de l'OMS, Tedros Adhanom Ghebreyesus, ha instat els africans a preparar-se per a "viure pitjor que la mala situació".