Al maig de 2020 van aparèixer nombrosos peixos morts en Arkaitzerreka i la Unitat Central Operativa de Medi Ambient de la Guàrdia Civil (UCOMA) va investigar l'entorn. En relació amb l'assumpte, el 13 de gener de 2022 diversos treballadors d'Ekobal i el GHK ho van declarar imputat. Ara, segons ha informat l'associació AnclSOS, ha publicat un acte (el 31 de maig de 2022) en el qual s'està investigant l'existència de delictes ecològics en el funcionament de la incineradora 5 de Donostia. Magistrats del Jutjat d'Instrucció. Aquest acte ha activat la recerca, que en paraules d'AnclSOS estava "paralitzada": en concret, el magistrat ha decidit encarregar dues recerques a la Guàrdia Civil.
La Guàrdia Civil, en el seu informe de recerca, afirma que els cloroalcanos són composts molt tòxics i que “poden causar càncer en l'home i altres danys greus en la salut i el medi ambient”, al mateix temps que aquesta substància “està prohibida a la UE des de 2004”. El magistrat ha encarregat a la Guàrdia Civil “localitzar l'origen o font d'emissió dels cloroalcanos (0,885 mg/kg) i els alts nivells de metalls que van aparèixer en el teixit d'una anguila morta”. AnclSOS ha assenyalat que "si es determinés que l'origen del cloroalcano es troba en la incineradora, el jutjat podria ordenar la paralització de l'activitat".
D'altra banda, el magistrat sol·licita a la Guàrdia Civil que estudiï la situació de seguretat de la incineradora en aquesta època: “Determinar les obres, sistemes de seguretat, proves de funcionament i seguretat, instal·lacions i altres mesures correctores o de seguretat i control precises, que tinguin per objecte evitar la dispersió de contaminants, evitar abocaments o garantir la seguretat dels treballadors i del medi ambient, en el moment i data dels fets en els quals no s'haguessin realitzat, instal·lat o provat el seu correcte funcionament”. "La instal·lació funcionava entre febrer de 2020 i el 70-80%, sense finalitzar les obres, sense realitzar les proves necessàries i sense autorització de posada en marxa", ha recordat SOS.
AnclSOS ha considerat "satisfactòria" la recerca sol·licitada pel jutge, "a pesar que no s'han acceptat totes les proves sol·licitades". A aquest efecte, aquesta setmana presenta un recurs d'apel·lació davant l'Audiència Provincial.
El magistrat afegeix tres noves imputacions personals. Entre ells es troba l'enginyer de camins, César Gimeno i el diputat de Medi Ambient, José Ignacio Asensio, i el president del GHK, "mà dreta" (segons ha declarat Ancestrals SOS). De fet, quan Iñaki Arriola va ser conseller de Transports en la legislatura 2009-2013, va nomenar a Asensio i vicepresident executiu a César Gimeno com a director general de la Xarxa de Ferrocarrils Bascos. Ancorant SOS recorda que l'acabat d'imputar Cessar Gimeno és un "exemple" de portes giratòries: Va ser Director General del Grup de Construcció Campezo, des d'on va passar a la presidència executiva de la citada Xarxa de Ferrocarrils Bascos i l'empresa Campezo va assumir l'adjudicació dels trams Bergara, Beasain i Ezkio-Itsaso per a l'execució del TAV.
Una altra entitat recentment imputada pel Jutjat d'Instrucció de Sant Sebastià és Ekondakin. És el concessionari de la construcció i gestió de la incineradora i forma part d'ella l'empresa inversora Meridiam, la multinacional xinesa de tractament de residus Urbaser, LKS i les empreses constructores: Altuna i Uría, Moyua i Murias.
Juntament amb la imputació d'Ekondakin, el jutge ha imputat també a l'organització instrumental anomenada Ekobal. Ekobal ha estat creada per l'empresa Ekondakin perquè en els pròxims 30 anys actuï la planta incineradora. També ha imputat a l'empresa alemanya SBE (Steinmuller Bakoc Enrionment), que va aportar tecnologia de forns al projecte i a la multinacional italiana Boldrochi, que va participar en la instal·lació de la cubeta investigada.
.