Encara que el Bidasoa creuada es va retirar l'exèrcit napoleònic, el general Emmanuel Rey va agafar Sant Sebastià amb 2.600 soldats. En els pròxims dies va haver-hi combats en pobles pròxims, com Hernani. Els exèrcits anglès i portuguès, aliats dels espanyols, van assetjar la ciutat immediatament. El 3 de juliol els vaixells de l'exèrcit britànic van bloquejar el port de Sant Sebastià i van desembarcar 300 homes a Pasaia, amb 26 canons i 8 morters. Els bombardejos que van començar el 14 de juliol finalitzarien amb la massacre del 31 d'agost. Una vegada a la ciutat, 1.600 donostiarres van ser assassinats i dones de totes les edats violades pels aliats espanyols.