Nascut a Pamplona, és catedràtic d'Història de l'Edat Moderna de la Universitat d'Alcalá de Madrid. En els últims 25 anys ha publicat nombrosos treballs relacionats amb la conquesta de Navarra, sobretot amb diferents interpretacions sobre la conquesta i el “procés d'incorporació” de Navarra a Castella. És membre de la Societat d'Estudis Històrics de Navarra, entre altres.

Floristán Imizcoz és el president de la comissió científica creada pel Govern de Navarra per a commemorar el cinquè centenari de la conquesta de 1512. El Govern de Navarra va defensar en el congrés sobre la conquesta de 2011 que es tractava d'una "empresa" desenvolupada per nobles castellans de l'entorn de la conquesta i no tant per una operació prevista per Fernando el Catòlic. En la revista Pregó de febrer de 2012, venuda juntament amb Diari de Navarra, Floristán Imizcoz aprofundeix en la mateixa teoria a Navarra en 1512: Qui va conquistar eta nork conquistat? en l'article.

“En la primera invasió de juliol de 1512, al costat d'un reduït nucli format per soldats professionals, van arribar uns castellans titulats amb els seus fills i deutors, així com les viles i milícies provincials de la zona. En les Ajudes de Pamplona de novembre de 1512 també es veu en la lluita de Noáin de 1515 i 1521: la ràpida mobilització de Castella més pròxima. (…) Probablement la de Navarra va ser una empresa ‘popular’ per a ells, igual que la conquesta portuguesa (1580) va ser per als castellans occidentals. (…)

Això ens suggereix que cal tenir en compte els elements qualitatius. Els conqueridors no sols havien vençut als conqueridors, sinó que eren més forts o més afortunats. (…) Caldrà replantejar les raons dels navarresos per a la lluita o no, i això ens porta a analitzar el paper que van jugar els beaumontesos i agramontesos. (…)

Malgrat el seu arrelament, cal descartar la idea que Fernando el Catòlic preveia la conquesta: va preparar el terreny, va decidir la invasió, va aprofitar l'oportunitat i… es va espantar de la seva sort. Segons diversos testimoniatges, quan l'exèrcit anglès que defensava a Guipúscoa es va fer a la mar, va pensar a abandonar l'ocupació i tornar enrere, per por de la reacció de França. Però aquests testimoniatges contraposen la integritat dels capitans i nobles castellans davant la inseguretat i incapacitat de decisió del Catòlic”.