En un principi, el Govern de Pedro Sánchez va mostrar la seva disconformitat amb catorze articles, però després de tractar a Navarra-Estat en la Comissió de Cooperació, es van arribar a acords en deu articles. El nucli del problema és molt antic i es basa en la voluntat política més que normativa; Madrid està fent un ús especial de les últimes dècades per a buidar de competències tant l'Estatut de Guernica com la Millora Foral aprovada fa quaranta anys.

En principi, les competències dels convenis i concessions administratives són de Navarra, però han de desenvolupar-se en el marc de l'estructura jurídica bàsica de l'Estat, la qual cosa permet a l'Estat establir el marc legal en el qual han de desenvolupar-se les competències.

Les discrepàncies se centren principalment en dos punts, un relatiu a la relació existent entre els negocis jurídics i les contractacions públiques, i el Govern Foral vol a la seva disposició quants serveis jurídics d'ells. L'altre és l'àmbit de la medicació, on el Servei Navarrès de Salut vol autonomia per a comprar medicacions, per exemple, sense treure-les a concurs públic. Madrid diu que les competències farmacèutiques són seves i això és contrari a la Llei 9/2017. L'assumpte serà ara resolt pel Tribunal Constitucional.