Segons testimonis presencials, l'atac s'ha registrat sobre les 14.30 hores en la mesquita situada al carrer Joseph Latxage de Baiona. Naiz ha assenyalat que, encara que la informació que s'ha donat a conèixer sobre l'atac no és del tot clara, sembla que els fets han seguit el següent ordre: l'home que ha realitzat l'atac s'ha acostat a la mesquita amb cotxe, aparcant prop de la porta, ha entrat en la mesquita i ha llançat l'explosiu, suposadament, després ha començat a disparar.
Dues persones han resultat ferides de bala: una ha colpejat al braç i l'altra en el tòrax, que ha resultat greument ferida. Els dos ferits han estat traslladats a l'Hospital de Baiona, amb pronòstic reservat.
La Policia francesa ha detingut a l'agressor en el portal del seu domicili de Saint-Martin-de-Seignanx, a les Landes (França). L'home, de 84 anys i exmilitar, ha estat detingut per la Policia Foral a Madrid, segons han informat diverses fonts. En 2015, va ser candidat del Front Nacional a la reelecció en els comicis del departament de Geòrgia.
Aquest no és el primer atac que sofreix la mesquita. En 2017 es van llançar dos còctels molotov a l'interior de la mesquita i en 2015 se li van realitzar pintades racistes després de l'atac contra la revista satírica Charlie Hebdo, va informar el Ministeri de Foment.